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genelink優(yōu)質(zhì)DNA寡核苷酸合成

 更新時間:2020-06-10 點(diǎn)擊量:1589

 

genelink優(yōu)質(zhì)DNA寡核苷酸合成

 

Unmodified Oligonucleotides (price per base)*
Product50 nmol scale200 nmol scale1 umol scale2 umol scale10 umol scale15 umol scale
Catalog No.26-6400-0526-6400-0226-6400-0126-6400-0326-6400-1026-6400-15
Unmodified Oligonucleotides$0.50$0.90$1.95$2.95$19.50$27.65
Maximum Length of Synthesis80 mer120 mer200 mer250 mer250 mer250 mer

 

凝膠純化

如果應(yīng)用將用于PCR或測序,則所有短于40 mer的Gene Link寡核苷酸都不需要進(jìn)一步純化。以99.5%的偶聯(lián)效率合成的20 mer寡核苷酸將包含?90%的全長20 mer和?10%的截短序列的混合物。隨著寡核苷酸長度的增加,即使在99.5%的偶聯(lián)效率下,全長寡核苷酸的產(chǎn)量也會降低。60 mer原油產(chǎn)品將包含?75%的全長寡核苷酸,同樣,100 mer將包含?60%。強(qiáng)烈建議對50 mer以上的寡核苷酸進(jìn)行純化。

 

純化(每個DNA寡核苷酸的價格)
產(chǎn)品50 nmol規(guī)模200 nmol規(guī)模1 umol量表2摩爾規(guī)模10 umol量表15 umol量表
貨號(PAGE)26-6400-7726-6400-7726-6400-5526-6400-8826-6400-4426-6400-99
凝膠純化(PAGE)75.0075.00150.00280.001500.001800.00
貨號(RPC)26-6400-1126-6400-1126-6400-2226-6400-2326-6400-3326-6400-34
反相純化(RPC)30.0030.0090.00170.00750.00900.00

 

寡核苷酸的合成規(guī)模和未修飾的DNA寡核苷酸的典型產(chǎn)量*
 原油脫鹽RPC純化**凝膠純化
20 mer oligo 
典型產(chǎn)量
30 mer oligo 
典型產(chǎn)量
50 mer oligo 
典型產(chǎn)量

規(guī)模

260

納摩爾

毫克

260

納摩爾

毫克

260

納摩爾

毫克

50納摩爾

8-1030+0.2-0.34-512+0.1-0.16NR * [1-2]NR * [2-4]NR * [0.03-0.06]

200納摩爾

20-2580+0.6-0.88-1224+0.26-0.44-68+0.13-0.2

1 ü摩爾

100-120400+3-440-5090+1.3-1.620-2540+0.6-0.8

2 û摩爾

200-240800+6-880-100180+2.5-3.140-5080+1.2-1.5

10 ù摩爾

?1000?4000?30?400?900?10?200?400?60

15 ù摩爾

?1500?6000?45?600?1350?15?300?600?90

純度和產(chǎn)率

純度大于80%

 

取決于寡核苷酸的序列和結(jié)構(gòu)。有關(guān)寡核苷酸長度相關(guān)的純度和產(chǎn)率,請參見偶聯(lián)效率表。

PCR和測序應(yīng)用無需進(jìn)一步純化。

凝膠純化建議用于50 mer以上的寡核苷酸以及涉及克隆和誘變的所有應(yīng)用。

** RPC是使用藥筒進(jìn)行的反相純化;HPLC的替代品。

純度85%至95%

 

取決于寡核苷酸序列和結(jié)構(gòu)

GC含量高的序列的收率和純度會更低

不建議用于35 mer以上的寡核苷酸。

** RPC是使用藥筒進(jìn)行的反相純化;HPLC的替代品。

純度98%至?100%

 

取決于寡核苷酸序列和結(jié)構(gòu)

隨著寡核苷酸長度的增加,產(chǎn)量將逐漸降低。回文,發(fā)夾和高GC含量的寡核苷酸以及包含3個或更多G鏈的寡核苷酸會誘導(dǎo)強(qiáng)烈的二級結(jié)構(gòu)和堿基堆積,從而降低純度和產(chǎn)量。

*不推薦NR

*一個。表中列出的典型產(chǎn)量是未修飾的隨機(jī)序列寡核苷酸。使用高GC含量的寡核苷酸和形成強(qiáng)二級結(jié)構(gòu)的寡核苷酸可觀察到產(chǎn)量降低。

b。改性寡核苷酸預(yù)計產(chǎn)量會降低。減少百分比隨修改類型和站點(diǎn)數(shù)量而變化。每個修飾位點(diǎn)的典型減少量為10%-20%。

C。對于等摩爾的堿基組成,計算出的DNA寡核苷酸的產(chǎn)量為33µg / A260。單基或均聚物的長拉伸將具有可變的產(chǎn)率。均聚物20 mer的示例:dA(20)=?25ug / A260單位;dC(20)=?40ug / A260單位; dG(20)=?32ug / A260單位和dT(20)=?37 ug / A260單位

 


 

合成后修飾的共軛/轉(zhuǎn)化(NHS,硫醇,馬來酰亞胺等)的合成和產(chǎn)率規(guī)模

Most oligo modifications are directly coupled using optimized automated DNA synthesis protocols that are suited for specific modifications. The final yield varies and are usually around 80% of the yield of the unmodified oligos. Multiple modifications and sites in the same oligo may lead to further reduction in final yield. 
Certain modification (e.g Alexa fluorescent dyes, digoxigenin, etc) are not available for direct autoamted coupling chemsitry and have to be conjugated using post synthesis methods involving amino group to NHS (N - hydroxysuccinimide) ester, thiols to maleimide and other post synthesis conversions. 
這些合成后的共軛反應(yīng)動力學(xué)可產(chǎn)生約60-85%的終產(chǎn)物,建議使用聚丙烯酰胺凝膠純化。這些合成后綴合的收率指南在下面列出。

合成的寡核苷酸規(guī)模和合成后修飾的典型產(chǎn)率* 
(NHS,馬來酰亞胺,堿轉(zhuǎn)化等)
 RPC純化**凝膠純化
20-40 mer oligo 
典型產(chǎn)量
20-40 mer oligo 
典型產(chǎn)量

規(guī)模

260

納摩爾

毫克

260

納摩爾

毫克

50納摩爾

?2?4?0.06?1?2?0.03

200納摩爾

?4?8?0.12?2.5?5?0.07

1 ü摩爾

?12?24?0.36?8?16?0.24

2 û摩爾

?20?40?0.6?15?30?0.45

10 ù摩爾

?100?200?3.0?75?150?2.25

15 ù摩爾

?150?300?4.5?112?225?3.36

純度和產(chǎn)率

純度60%至80%

 

取決于寡核苷酸序列和結(jié)構(gòu)

GC含量高的序列的收率和純度會更低

不建議用于35 mer以上的寡核苷酸。

** RPC是使用藥筒進(jìn)行的反相純化;HPLC的替代品。

純度85%至?98%

 

取決于寡核苷酸序列和結(jié)構(gòu)

隨著寡核苷酸長度的增加,產(chǎn)量將逐漸降低。回文,發(fā)夾和高GC含量的寡核苷酸以及包含3個或更多G鏈的寡核苷酸會誘導(dǎo)強(qiáng)烈的二級結(jié)構(gòu)和堿基堆積,從而降低純度和產(chǎn)量。

*不推薦NR

*一個。使用高GC含量的寡核苷酸和形成強(qiáng)二級結(jié)構(gòu)的寡核苷酸可觀察到產(chǎn)量降低。

b。改性寡核苷酸預(yù)計產(chǎn)量會降低。減少百分比隨修改類型和站點(diǎn)數(shù)量而變化。每個修飾位點(diǎn)的典型減少量為10%-20%。

C。對于等摩爾的堿基組成,計算出的DNA寡核苷酸的產(chǎn)量為33µg / A260。單基或均聚物的長拉伸將具有可變的產(chǎn)率。均聚物20 mer的示例:dA(20)=?25ug / A260單位;dC(20)=?40ug / A260單位; dG(20)=?32ug / A260單位和dT(20)=?37 ug / A260單位

 

 

 

 

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